Салтанат Абильханова родилась в г.Кзыл-Орда (Казахстан). После окончания Алматинской государственной консерватории им. Курмангазы по двум специальностям «фортепиано» и «орган» начала работу преподавателем в Казахской Национальной Академии (г.Астана).

В 2005 году приняла участие в первом Международном фестивале органной музыки. В 2006 - получила стипендию ДААД в HMT им. F.M.Bartholdy (Высшая школа музыки и театра им. Ф.Мендельсона-Бартольди) Leipzig (Германия) по специальности «орган», закончила обучение в 2010 году. Была на мастерклассах у профессоров:Hans Davidsson (USA), Martin Haselboeck (Austria), Martin Sander (Germany), Wolfgang Zerer (Germany), Wolfgang Ruebsam (USA), Michael Radulescu (Austria) и др.

С 2010 года является руководителем органного класса в Казахском Национальном Университете Искусств, ведет интенсивную концертную деятельность в Казахстане и за его пределами (Германия, Испания, Финляндия, Россия, Эстония, Узбекистан и др.).

Принимает участие в Международных органных конкурсах в качестве жюри. С 2019 года - доцент кафедры Фортепиано и органа.

Имеет награды Отличника культуры и Почетного работника образования Республики Казахстан.